流感病毒通常不会直接导致扁桃体炎，但可诱发免疫应答，进而引发继发性细菌感染，从而增加患扁桃体炎的风险。
流感病毒感染时，呼吸道上皮细胞受到损伤，使呼吸道防御功能下降，有利于细菌定植和繁殖，易发生继发性细菌感染，其中以溶血性链球菌最为常见。而扁桃体位于咽部两侧，是淋巴器官的一部分，当其受到病原体入侵时，会发生炎症反应，表现为扁桃体充血、肿胀等症状。因此，流感病毒感染后，若未及时治疗或个人卫生不佳，可能导致继发性细菌感染，进一步发展为扁桃体炎。
部分患者还可能会出现发热、头痛、全身酸痛等不适症状。
预防流感可通过注射疫苗、勤洗手、戴口罩等方式来降低感染风险。对于存在慢性疾病或免疫力低下者，更需注意防范，以免因感染导致并发症的发生。
